1. Bu site çerezler kullanır. Bu siteyi kullanmaya devam ederek çerez kullanımımızı kabul etmiş olursunuz. Daha Fazla Bilgi.

Blast

'İstatistik ve Biyoistatistik' forumunda statist tarafından 14 Ocak 2013 tarihinde açılan konu

  1. statist

    statist Moderator

    DNA dizilerinde A,C,G,T bazlarının dizilişi, RNA dizilerinde A,C,G,U bazlarının dizilişi ve protein dizilerinde amino asitlerin dizilişi bakımından, ortak bir alfabe ile yazılmış dizilerin hizalanması üzerinde duruldu. Hizalanmış veya hizalanmamış iki dizi arasındaki benzerlik nasıl ölçülecektir. Elimizdeki nükleik asit veya amino asit dizilerinden oluşan bir veri tabanındaki dizilerden hangileri, verilen (gözlenen) bir dizi parçasına daha çok benzemektedir? Bir veri tabanındaki diziler ile verilen başka bir dizi arasındaki anlamlı benzerliklerin olup olmadığının ortaya çıkarılmasında (test edilmesinde) kullanılan yöntemlerden birisi BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) ‘dır. Bu yöntemi üç aşamada ele alacağız. Đlk olarak gediksiz hizalanmış eşit uzunluklu dizilerde benzerlik testleri, sonra herhangi iki dizi için benzerlik testleri üzerinde durup, sonunda gedikli hizalamada benzerlik testlerine değinilecektir.
     

    Ekli dosyalar:

    • BLAST.pdf
      Dosya Boyutu:
      77.6 KB
      Gösterim:
      30
    Tags:

Bu Sayfayı Paylaş

  1. Bu site çerezler kullanır. Bu siteyi kullanmaya devam ederek çerez kullanımımızı kabul etmiş olursunuz. Daha Fazla Bilgi.
  1. Bu site çerezler kullanır. Bu siteyi kullanmaya devam ederek çerez kullanımımızı kabul etmiş olursunuz. Daha Fazla Bilgi.
Yükleniyor...