Öncelikle EndNote programında bir kütüphane oluşturuyorsunuz. Kütüphaneyi oluşturduktan sonra EndNote penceresini aşağıda gösterilen kırmızı buton yardımı ile Online Mod'u aktif ediyorsunuz. (Integrated Library and Online Mod'da seçilebilir ancak bu durumda taranan tüm kayıtlar otomatik olarak kütüphaneye kaydedilecektir) Ardından öncelikle hangi veritabanında arama yapacağımızı (kırmızı alan) seçiyoruz. Buradaki veritabanları sizde olmayabilir. Veri tabanlarını ekleyip silebiliyorsunuz ve bazılarına erişim yetkiniz olmayabilir. Erişim yetkisi üniversiteniz ve/veya kullanıcı adı şifrenize bağlı olabilir. Ardından arama kriterlerini doldurup (mavi alan) "Search" butonuna basıyoruz. Bulunan kayıtların bir veya birden fazlasını (hatta tamamını) OK tuşu yardımıyla listeliyoruz. Bulduğumuzu düşündüğümüz yayını sağ tıklayarak "Copy referans to" altından kendi kütüphanemize kaydediyoruz. Kendi kütüphanemizin ismi "Test kütüphanesi" olduğu durumda bu yayın bilgileri "Test kütüphanesine" aktarılacaktır. Son olarak "find full text" dediğimizde eğer erişimimiz varsa makale "pdf" olarak bilgisayarımıza kaydedilecektir. Bu aşamadan sonra pdf üzerinde gerekli işlemleri yapabiliriz. Bu yazıda anlatılanlar EndNote 8.0.2 için geçerlidir. Sizin sürümünüzde küçük farklılıklar olabilir.